Die Räumlichkeiten der Trotte Villigen sind auf drei Etagen verteilt. Auf der Höhe der Trottengasse befinden sich der grosse Saal, die Küche und die sanitären Anlagen.
Im Zwischengeschoss, beim Ausgang zum Aussenbereich liegt die Garderobe. Hier kann auch ein kleiner Apéro serviert werden.
Die Galerie im obersten Geschoss beinhaltet das grosse, offene Feuer. Auf der Galerie können bis 50 Personen bewirtet werden.
Die ganze Trotte ist Rollstuhlgängig eingerichtet.